Benthic biodiversity in four pairs of Norwegian lakes

Registros biológicos
Última versión publicado por Norwegian Institute for Nature Research el dic 8, 2022 Norwegian Institute for Nature Research
Fecha de publicación:
8 de diciembre de 2022
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

The aim of the project was to assess the effect of water-level regulation on diversity of lake littoral meiofauna and protists. Littoral fine-gravel bottoms of four pairs of Norwegian lakes were sampled in June and September 2021. Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol. In total, the dataset contains 101 samples, including 5 control samples and 96 samples from the lakes. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna). Caution should be exercised when interpreting occurrences of single species, as the DNA metabarcoding and bioinformatics may contain errors. The effect of regulation on species richness and change in community composition (Alpha-diversity) was assessed using mixed effects models.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 39.347 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
39347
dnaDerivedData 
39347

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Norwegian Institute for Nature Research. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 536649eb-a529-4f6d-b97c-0c31b5f75a2d.  Norwegian Institute for Nature Research publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Norway.

Palabras clave

Occurrence

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Contactos

Markus Majaneva
  • Originador
  • Punto De Contacto
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Matthew Grainger
  • Proveedor De Los Metadatos
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Roald Vang
  • Punto De Contacto
Section manager
NINA
Trondheim
NO

Cobertura geográfica

Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderåy, Fosen and Skaun Municipalities in Trøndelag County, Norway

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [62,714, 6,24], Latitud Máxima Longitud Máxima [66,249, 15,029]

Cobertura taxonómica

Benthic Invertebrates

Filo Apicomplexa, Apusomonadidae, Centroheliozoa, Cercozoa, Chlorophyta, Choanoflagellida, Chrompodellids, Ciliophora, Conosa, Cryptophyta, Dinoflagellata, Discoba, Fungi, Glaucophyta, Haptophyta, Hemimastigophora, Hilomonadea, Katablepharidophyta, Lobosa, Mesomycetozoa, Metamonada, Metazoa, Ochrophyta, Opalozoa, Perkinsea, Pseudofungi, Rhodophyta, Sagenista, Stramenopiles, Streptophyta, Telonemia

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2021-06-08 / 2021-09-15

Datos del proyecto

No hay descripción disponible

Título Benthic biodiversity in four Norwegian reservoirs

Personas asociadas al proyecto:

Markus Majaneva

Métodos de muestreo

Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol.

Área de Estudio Trøndelag County Norway, in the Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderøy, Fosen and Skaun Municipalities

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna).

Referencias bibliográficas

Metadatos adicionales