Benthic biodiversity in four pairs of Norwegian lakes

オカレンス(観察データと標本)
最新バージョン Norwegian Institute for Nature Research により出版 12月 8, 2022 Norwegian Institute for Nature Research
公開日:
2022年12月8日
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

The aim of the project was to assess the effect of water-level regulation on diversity of lake littoral meiofauna and protists. Littoral fine-gravel bottoms of four pairs of Norwegian lakes were sampled in June and September 2021. Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol. In total, the dataset contains 101 samples, including 5 control samples and 96 samples from the lakes. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna). Caution should be exercised when interpreting occurrences of single species, as the DNA metabarcoding and bioinformatics may contain errors. The effect of regulation on species richness and change in community composition (Alpha-diversity) was assessed using mixed effects models.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、39,347 レコードが含まれています。

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Occurrence (コア)
39347
dnaDerivedData 
39347

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バージョン

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権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Norwegian Institute for Nature Research。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 536649eb-a529-4f6d-b97c-0c31b5f75a2dが割り当てられています。   GBIF Norway によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているNorwegian Institute for Nature Research が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

連絡先

Markus Majaneva
  • 最初のデータ採集者
  • 連絡先
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Matthew Grainger
  • メタデータ提供者
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Roald Vang
  • 連絡先
Section manager
NINA
Trondheim
NO

地理的範囲

Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderåy, Fosen and Skaun Municipalities in Trøndelag County, Norway

座標(緯度経度) 南 西 [62.714, 6.24], 北 東 [66.249, 15.029]

生物分類学的範囲

Benthic Invertebrates

Phylum Apicomplexa, Apusomonadidae, Centroheliozoa, Cercozoa, Chlorophyta, Choanoflagellida, Chrompodellids, Ciliophora, Conosa, Cryptophyta, Dinoflagellata, Discoba, Fungi, Glaucophyta, Haptophyta, Hemimastigophora, Hilomonadea, Katablepharidophyta, Lobosa, Mesomycetozoa, Metamonada, Metazoa, Ochrophyta, Opalozoa, Perkinsea, Pseudofungi, Rhodophyta, Sagenista, Stramenopiles, Streptophyta, Telonemia

時間的範囲

開始日 / 終了日 2021-06-08 / 2021-09-15

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル Benthic biodiversity in four Norwegian reservoirs

プロジェクトに携わる要員:

Markus Majaneva

収集方法

Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol.

Study Extent Trøndelag County Norway, in the Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderøy, Fosen and Skaun Municipalities

Method step description:

  1. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna).

書誌情報の引用