Benthic biodiversity in four pairs of Norwegian lakes

Occurrence
Dernière version Publié par Norwegian Institute for Nature Research le déc. 8, 2022 Norwegian Institute for Nature Research
Date de publication:
8 décembre 2022
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

The aim of the project was to assess the effect of water-level regulation on diversity of lake littoral meiofauna and protists. Littoral fine-gravel bottoms of four pairs of Norwegian lakes were sampled in June and September 2021. Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol. In total, the dataset contains 101 samples, including 5 control samples and 96 samples from the lakes. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna). Caution should be exercised when interpreting occurrences of single species, as the DNA metabarcoding and bioinformatics may contain errors. The effect of regulation on species richness and change in community composition (Alpha-diversity) was assessed using mixed effects models.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 39 347 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
39347
dnaDerivedData 
39347

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Norwegian Institute for Nature Research. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 536649eb-a529-4f6d-b97c-0c31b5f75a2d.  Norwegian Institute for Nature Research publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Norway.

Mots-clé

Occurrence

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Contacts

Markus Majaneva
  • Créateur
  • Personne De Contact
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Matthew Grainger
  • Fournisseur Des Métadonnées
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Roald Vang
  • Personne De Contact
Section manager
NINA
Trondheim
NO

Couverture géographique

Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderåy, Fosen and Skaun Municipalities in Trøndelag County, Norway

Enveloppe géographique Sud Ouest [62,714, 6,24], Nord Est [66,249, 15,029]

Couverture taxonomique

Benthic Invertebrates

Phylum Apicomplexa, Apusomonadidae, Centroheliozoa, Cercozoa, Chlorophyta, Choanoflagellida, Chrompodellids, Ciliophora, Conosa, Cryptophyta, Dinoflagellata, Discoba, Fungi, Glaucophyta, Haptophyta, Hemimastigophora, Hilomonadea, Katablepharidophyta, Lobosa, Mesomycetozoa, Metamonada, Metazoa, Ochrophyta, Opalozoa, Perkinsea, Pseudofungi, Rhodophyta, Sagenista, Stramenopiles, Streptophyta, Telonemia

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2021-06-08 / 2021-09-15

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre Benthic biodiversity in four Norwegian reservoirs

Les personnes impliquées dans le projet:

Markus Majaneva

Méthodes d'échantillonnage

Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol.

Etendue de l'étude Trøndelag County Norway, in the Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderøy, Fosen and Skaun Municipalities

Description des étapes de la méthode:

  1. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna).

Citations bibliographiques

Métadonnées additionnelles