Benthic biodiversity in four pairs of Norwegian lakes

Occurrence
Последняя версия опубликовано Norwegian Institute for Nature Research дек. 8, 2022 Norwegian Institute for Nature Research
Дата публикации:
8 декабря 2022 г.
Опубликовано:
Norwegian Institute for Nature Research
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 39 347 Записи в English (3 MB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (15 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Описание

The aim of the project was to assess the effect of water-level regulation on diversity of lake littoral meiofauna and protists. Littoral fine-gravel bottoms of four pairs of Norwegian lakes were sampled in June and September 2021. Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol. In total, the dataset contains 101 samples, including 5 control samples and 96 samples from the lakes. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna). Caution should be exercised when interpreting occurrences of single species, as the DNA metabarcoding and bioinformatics may contain errors. The effect of regulation on species richness and change in community composition (Alpha-diversity) was assessed using mixed effects models.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 39 347 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
39347
dnaDerivedData 
39347

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Norwegian Institute for Nature Research. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 536649eb-a529-4f6d-b97c-0c31b5f75a2d.  Norwegian Institute for Nature Research отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Norway.

Ключевые слова

Occurrence

Внешние данные

Ресурс также доступен в других форматах

Контакты

Markus Majaneva
  • Originator
  • Point Of Contact
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Matthew Grainger
  • Metadata Provider
Researcher
NINA
Trondheim
NO
Roald Vang
  • Point Of Contact
Section manager
NINA
Trondheim
NO

Географический охват

Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderåy, Fosen and Skaun Municipalities in Trøndelag County, Norway

Ограничивающие координаты Юг Запад [62,714, 6,24], Север Восток [66,249, 15,029]

Таксономический охват

Benthic Invertebrates

Phylum Apicomplexa, Apusomonadidae, Centroheliozoa, Cercozoa, Chlorophyta, Choanoflagellida, Chrompodellids, Ciliophora, Conosa, Cryptophyta, Dinoflagellata, Discoba, Fungi, Glaucophyta, Haptophyta, Hemimastigophora, Hilomonadea, Katablepharidophyta, Lobosa, Mesomycetozoa, Metamonada, Metazoa, Ochrophyta, Opalozoa, Perkinsea, Pseudofungi, Rhodophyta, Sagenista, Stramenopiles, Streptophyta, Telonemia

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2021-06-08 / 2021-09-15

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Benthic biodiversity in four Norwegian reservoirs

Исполнители проекта:

Markus Majaneva

Методы сбора

Lakes were sampled in pairs that had similar water-quality but one of which was regulated and the other was unregulated. The bottom material was sampled at 30-40 cm depth, 1-5 m from the shoreline. Six replicate samples from each sampling point was taken by lowering a 25-cm diameter cylinder (12 cm high) to the bottom and 5 spoons of the bottom material from inside the cylinder was transferred to each sample bottle. No macroinvertebrates (size > 1 mm) were observed in the spoons before emptying them to the sample bottles. Water was filtrated out of the bottles using a 10 µm mesh, and then, samples were stored in 96-% ethanol.

Охват исследования Trøndelag County Norway, in the Meråker, Orkland, Melhus, Leksvik, Inderøy, Fosen and Skaun Municipalities

Описание этапа методики:

  1. Taxonomic composition of bottom-dwelling meiofauna and protists was determined using DNA metabarcoding of the V4 fragment of the 18S rRNA gene. Taxa were identified using the PR2 reference database (protists) and NCBI GenBank nucleotide database (meiofauna).

Библиографические ссылки

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://ipt.nina.no/resource?r=benthic_biodiversity_in_regulated_lakes